A Coordenadoria Estadual faz o monitoramento dos 51 municípios no Estado que possuem o incentivo fundo a fundo para HIV/Aids do Ministério da Saúde, orientando quanto às ações prioritárias. Os PAM ( Programas de Ações e Metas) são analizados depois de aprovados nos Conselhos Municipais de Saúde, e encaminhados ao Programa Nacional de DST/Aids, assim como o PAM do Estado, elaborado pela coordenação.São 27 os CTA ( Centro de Testagem e Aconselhamento) cadastrados no Estado, trabalhando com prevenção e testagem para HIV, sífilis e hepatites.